A eleição de 2020, marcou uma nova era para o município de Água Boa. A disputa acirrada entre os candidatos a prefeito, Dr. Mariano e Maurício Tonhá, contou com o empenho total do deputado estadual Dr. Eugênio, que tem sua base no município.
Ao fim da apuração, Dr Mariano teve 51,57% dos votos, sendo 6.747 no total.
Dr. Mariano derrotou Mauricio, que ficou em segundo lugar com 48,43% (6.336 votos).
A eleição em Água Boa teve 26,29% de abstenção, 0,75% votos brancos e 2,66% votos nulos.
Dr. Eugênio, que possuí domicílio na cidade, passou grande parte da campanha eleitoral se dedicando a campanha em Água Boa e aos municípios do Araguaia, representado o PSB.